綠色力量發布「東涌河生態及水質調查」結果，顯示東涌河下游錄得27種蜻蜓，河口及下游分別錄得22種及11種原生魚類，物種數量未回復至2021年東涌新市鎮擴展工程前的水平。水質方面，東河下游比電導值平均119.3 μS/cm，氨氮值及磷酸鹽磷值分別為每升0.061毫克及0.029毫克，反映受生活及工業污水污染。環境事務經理盧詠鋒呼籲政府採取更多保育措施，保護這條香港罕見的大型天然河流生態。
調查顯示，東涌河自2018年起受工程影響，蜻蜓物種從平均32種跌至2023年的24種，2025年回升至27種，部分物種如褐斑異痣蟌已絕跡；原生魚類在河口由平均26種跌至2023年的13種，下游由11種跌至2022年的6種，2025年分別回升至22種及11種。盧詠鋒指土地平整工程破壞蜻蜓棲息地及改變河床結構，影響魚類生境，沉積物擴散進一步加劇生態壓力。
盧詠鋒建議政府升級防護措施，包括在鄉村雨水渠及施工區設沉澱池及淨化設施，攔截污染物，並重建生態池塘補償棲息地。他強調當局應參考中國2017年的《淡水生物水質基準推導技術指南》，制定本地生態水質標準，加強巡查及執法，改善水質並保護東涌河的生物多樣性。
